マルチスケール X - 海南プラスチックボトルグループ株式会社

Scientific Data volume 9、記事番号: 264 (2022) この記事を引用

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2 引用

1 オルトメトリック

メトリクスの詳細

明るくコヒーレントなシンクロトロン光源を使用した X 線イメージングの技術進歩により、部分的に脱水した柔らかい組織の微細構造に対する高い感度を維持しながら、サンプルサイズと解像度を切り離すことが可能になりました。マルチスケール X 線イメージングの継続的な開発により、細胞レベルまでの分解能と感度を備えた臓器スケール (最大数十センチメートル) の軟組織イメージングの課題に対処する包括的なアプローチである階層型位相コントラスト断層撮影法が誕生しました。この技術を使用して、ボクセルサイズを6.05〜6.5μmおよび2.45〜2.5μmまでローカルズームするとともに、25.08μmの等方性ボクセルサイズでヒトの左肺全体を生体外で画像化しました。欧州放射光施設の第 4 世代放射光源によってもたらされる高い組織コントラストは、巨視的 (センチメートル) から微視的 (マイクロメートル) スケールまで、人間の肺の複雑でマルチスケールの解剖学的構成を明らかにします。このデータセットは、二次肺小葉の包括的な臓器スケールの 3D 情報を提供し、前例のない詳細さで肺結節の微細構造を描写します。

測定

人間の左肺

テクノロジーの種類

X線位相コントラストイメージング

人間の肺は、人体の中で最大の実質臓器の 1 つです。従来、臓器スケールでの肺の微細解剖学の研究には、対象を絞ったサンプリング、組織の準備、組織学的染色、および切片作成などの長時間の作業が必要でした1,2。現在、肺全体の微細構造の ex vivo 臨床評価は、ボクセルサイズ約 100 μm の吸収コントラストマイクロ CT を使用して、切片化せずに実行されています。その後、組織学を使用して、肺の限られた領域を選択して、より高い解像度で画像化することができます3、4、5。 X 線位相コントラストイメージング 6,7 は、実験室用マイクロ CT 8 よりも高い感度とコントラストを提供します。光学的仮想組織学9と比較して、自由空間伝播からのX線位相コントラストはイメージング光学系を必要とせず、同時に光学イメージングに不可欠な骨の折れる組織の除去や蛍光標識の必要性を排除します10。 X 線位相コントラストイメージングと既存の X 線源との互換性により、段階的な導入と前臨床研究から臨床診断への移行が促進されます 6,11,12。シンクロトロン施設では、過去数十年にわたる X 線源とイメージング技術の系統的なアップグレード 13,14 により、有意義なスケールと解像度にわたって生物学的疑問に取り組む手段が提供されています 11,15,16,17,18,19,20。シンクロトロンベースの X 線イメージングは、実験室用マイクロ CT よりも微細な解剖学的詳細にアクセスできますが 19、21、22、23、多くのバイオイメージングシナリオでは、顕微鏡解像度を維持しながら、イメージングスループットのさらなる拡大と大きなサンプルサイズへの対応が必要です 24、25。

最新の第 4 世代シンクロトロン源で達成される高い X 線光子束と空間コヒーレンス、およびサンプル前処理と画像化プロトコルの慎重な設計のおかげで、完全で大きく、部分的に脱水した人間の臓器全体をマイクロメートルで画像化することが可能になりました。階層的位相コントラスト断層撮影法 (HiP-CT) を使用した解像度 26。この技術は、高エネルギーの多色 X 線と調整可能な検出設定から得られる伝播位相コントラストを利用して、マルチスケールイメージングワークフロー 4、27、28、29、30 を 1 つのセットアップに統合します。したがって、人間の臓器全体（各寸法が 5 ～ 30 cm）を複数の解像度でスキャンすることは、サンプルを解剖したり、別の機器の場所や施設に輸送したりすることなく実行できます27、28、30。 HiP-CT は、カスタマイズされたフラットフィールド補正、減衰スキャンプロトコル、効率的な断層撮影サンプリングおよびステッチングパイプラインを備えており、染色 27,31 または透明化 10 することなく、大きな軟組織臓器を完全にカバーします。 HiP-CT26 の統合された単一モダリティ、マルチスケールイメージングアプローチにより、長さスケール全体で一貫した組織コントラストが得られるため、画像レジストレーション手順が簡素化されます。そのイメージングプロトコルは、既存のマルチスケールアプローチ4、18、19、29からインスピレーションを得ており、臓器全体の2段階の断層撮影サンプリング（全視野断層撮影）から始まり、その後、局所断層撮影を通じて微小解剖学の選択された特徴に段階的にズームインします。関連する解剖学的コンテキストと互換性のあるさまざまなより細かい解像度で。 HiP-CT では、軟部組織臓器などのサンプルを 70% エタノール水溶液に埋め込み、イメージング全体を通じて寒天ブロックで固定する必要があります (図 1a、b を参照)。フラットフィールド補正では、サンプルジャーと同じサイズの別の容器（基準ジャー）からの参照を取得して、軟組織のコントラストを強調します（図1cを参照）。ここでは、HiP-CT によって 25.08 μm のボクセルサイズ (完全な臓器、図 1d を参照)、およびさまざまな関心のある局所ボリュームの 6.05 ～ 6.5 μm および 2.45 ～ 2.5 μm のボクセルサイズで画像化された無傷のヒト左肺のデータセットを提供します ( VOI) は、入射 X 線スペクトル、伝播距離、シンチレーターの厚さ、検出器前の結合光学系の最適化によって実現されます (「方法」を参照)。 X 線イメージング実験は、最近アップグレードされた第 4 世代の超高輝度 X 線源 (ESRF-EBS) を使用して、欧州放射光施設 (ESRF) BM05 ビームラインで実施されました 32,33。

(a) 側面 (左) および内側 (右) から見た人間の左肺。 (b) 点滴固定した全肺を、70% エタノール溶液と寒天ブロックで満たされた、サイズ互換性のある密閉されたプラスチック円筒形 PET ジャー (直径 140 mm、高さ 260 mm) に取り付けます。 (c) ESRF BM05 ビームラインでの明るくコヒーレントな X 線からの伝播位相コントラストを使用した HiP-CT イメージングセットアップのスケッチ。参照ジャーには、サンプルジャーと同じ包埋媒体が含まれています。入射 X 線エネルギーは、解像度の要件に応じてフィルターを通じて 70 ～ 85 keV に調整されます。（ d ）HiP-CTを使用して、側面（左）および内側（右）のビューで25.08μmのボクセルサイズで画像化された左肺全体のボリュームレンダリング。 a、b、d でラベル付けされた主要な解剖学的特徴は、(1) 左上葉、(2) 葉間裂、(3) 左下葉、(4) 左主幹気管支です。

左肺全体（図 1a を参照）は、表 1 に示す医療記録を持つ、自然死した 94 歳の女性である献体者から採取されました。献体は、生前に提供者の自由な同意に基づいて行われました。。関連する死後医療処置は、死体研究の品質評価スケールの推奨事項に従って、フランセーズ解剖研究所 (LADAF) で実施されました 34。すべての解剖では故人の記憶が尊重されました。輸送と画像処理のプロトコルは、フランスの献体法によって承認されました。死亡したドナーの遺体には防腐処理が施され、死後約36時間で肺の準備が行われた。 30cmの水柱陽圧を使用して、気管を通して肺に4%ホルマリン溶液を注入した。次いで、肺を潰れない状態に固定するために、気管を結紮して膨張した形状を維持した。その後、遺体は解剖前に 3 日間 4 °C で保管されました。肺を取り出したら、さらに 3 日間 4% ホルマリン溶液に浸しました。その後、濃度を 70% (体積分率) まで増加させながら、エタノール溶液 (無臭バイオエタノール、Cheminol、フランス) に連続的に浸漬しました。エタノール脱水中、注射器で主気管支に溶液を繰り返し押し込むことにより肺を膨張させた。水 (1000 kg/m3) と比較してエタノールの密度 (789 kg/m3) が大幅に低いため、軟組織に高いベースコントラストが得られます 35,36。

X 線イメージングには肺と同等のサイズの PET (ポリエチレンテレフタレート) ジャーを使用しました。これは、市販されており (キャップ付き 3600 mL スイープジャー、Medline Scientific、英国)、高い放射線耐性 37 とサンプルの位置合わせを支援する光学的透明性が理由です。イメージング中のサンプルの状態の評価。肺を所定の位置にしっかりと固定し、容器の四方の端に触れないようにするために、寒天（フランス、ナアリの野生の赤い海藻からの寒天粉末）ブロックを約 1 cm3 の立方体で準備し、積み重ねました。瓶の底と臓器の周りに肺をしっかりと埋め込みます。寒天調製手順は以前に詳しく説明されています26。小さな寒天ブロック間の隙間は、残留ガスを除去するための逃げ道となります。サンプルマウント手順では、寒天とエタノールの混合物の充填と穏やかな真空脱気を交互に行い、溶液環境および臓器内の溶存空気から存在する微小気泡を最小限に抑え、それによってイメージングへの干渉を排除します。脱気手順では、密閉した真空ガラス乾燥機内で蓋を開けた状態で、膜ポンプを使用して PET サンプル瓶の上に直接ポンプ 38 を送りました。イメージングの前に、肺、エタノール溶液、および寒天包埋物を含む PET ジャーを特注のサンプルホルダーに置き、シンクロトロンビームラインの回転ステージに接続しました26。

HiP-CT の実装と機能については、別の出版物で詳しく説明されています26。ここでは、肺イメージングに使用される設定について説明します。すべての X 線イメージング実験は ESRF 偏向電磁石ビームライン BM0539 で実行されました。ビームラインで生成された多色シンクロトロンビームは、一連のフィルターを通過し、追加の X 線光学機器を使用せずにイメージングに直接使用されました。ボクセルサイズは、LuAG:Ce (セリウムドープルテチウムアルミニウムガーネット) X 線シンチレーター (チェコの Crytur 社製) の後、sCMOS (科学的相補金属) の前に位置する調整可能な可視光イメージング光学系によって効果的に制御されます。酸化物半導体）光センサー（PCO エッジ 4.2 CLHS、PCO Imaging、ドイツ）。具体的には、結像光学系には dzoom (「縮小ズーム」) とズームレンズが含まれており、それぞれ 6.5 ～ 25.5 μm と 1.3 ～ 6.3 μm の範囲をカバーします。放射光ビームのサイズ（BM05では使用可能エリア50mm×4mm）は人間の左肺のサイズ（容器サイズ高さ260mm、最大幅140mm）に比べてかなり小さいため、左肺全体を撮影することができます。 25.08 μm のボクセルサイズでは、複数のサブスキャンをつなぎ合わせる必要がありました。 ESRF で開発されたハーフ取得 (またはハーフオブジェクト取得)40 方法を使用して、ボクセルサイズ 6.5 μm および 2.5 μm で VOI をイメージングしました。肺全体については、完全な水平範囲をカバーするために環状スキャンと組み合わせた半分の収集を含む 4 分の 1 収集方法 26 を開発しました (図 2 を参照)。

複数の長さスケールでのシンクロトロンベースの階層的位相コントラスト断層撮影 (HiP-CT) と、それに関連するデータ収集および画像再構成パイプライン。ボクセルサイズ 25.08 μm のフルフィールド断層撮影データはパイプライン (a) で処理されます。 6.05 ～ 6.5 μm (レベル 1) および 2.45 ～ 2.5 μm (レベル 2) のボクセルサイズの関心ボリューム (VOI) の局所断層撮影データは、パイプライン (b) で処理されます。 (c) HiP-CT で画像化されたさまざまな円筒ボリュームの関係を示す概略図。サブスキャンを結合する前のパイプライン内の三重矢印は、同じ手順が各サブスキャンで実行されることを示します。

測定された X 線投影のデータ処理は、再構成前、再構成、再構成後の 3 つの段階で構成されます。これらは図 2 の別の行に示されています。検出器からのリングアーチファクトは 2 つのステップで補正されます。 (1) 再構成前再構成では、投影の平均が投影から減算され、一定の強度のリングを含むリングが除去されます。 (2) 再構成後、線形運動ぼかしフィルター 41 と組み合わせた極変換を使用して、残留する不均一な強度リングを除去しました。トモグラフィー再構成では、Paganin の方法 42 から得られた位相と振幅の推定値を使用し、その後、フィルター処理された逆投影アルゴリズムの入力として、取得された位相マップの 2D アンシャープマスクが使用されます。これらの再構成手順は PyHST243 で実装されます。最終的に、処理されたボリュームは 16 ビット形式に変換され、さらにビン化されて、表 2 ～ 3 に示すデータセットが生成されます。 3 種類の撮像サンプルボリュームの再構成および後処理手順をそれぞれ図 2 に示します。主要なパラメータを含む、各撮像解像度での人間の肺の撮像および再構成プロトコルを以下にまとめます。

全視野断層撮影（ボクセルサイズ25.08μmの臓器全体、図2a、cを参照）：フィルターとサンプル後の検出されたX線エネルギーは平均約93 keV、伝播距離は3475 mm、シンチレーターの厚さは2でしたんん。合計で、2 セットの 9990 個の投影が、半分の取得に 800 ピクセルのオフセットを使用した 4 分の 1 取得方法 26 によって測定されました。垂直 (z) 方向に 2.2 mm のステップサイズを使用して、合計 98 の 4 分の 1 取得サブスキャンでサンプルジャーの高さをカバーしました。再構成の前に、半分の取得スキャン 40 を復元するために、まず X 線撮影のステッチングが実行されました。

レベル1 VOIの局所断層撮影（ボクセルサイズ6.5μmおよび6.05μm、図2b、cを参照）：フィルターとサンプル後の検出されたX線エネルギーは平均〜88keV（〜89keV）、伝播距離は3500mmでした(3475 mm)、ボクセルサイズが 6.5 μm (6.05 μm) の VOI の場合、シンチレーターの厚さは 1 mm (2 mm) でした。合計 6000 個の投影が、900 ピクセルのオフセットを使用した半取得法によって測定されました。垂直方向の 2.2 mm のステップサイズを使用して、VOI の高さをカバーしました。

レベル2 VOIの局所断層撮影（ボクセルサイズ2.5μmおよび2.45μm、図2b、cを参照）：フィルターとサンプル後の検出されたX線エネルギーは平均約77keV（約79keV）であり、伝播距離は1440mmでした(1500 mm)、ボクセルサイズ 2.5 μm (2.45 μm) の VOI の場合、シンチレーターの厚さは 0.25 mm (0.2 mm) でした。合計 6000 個の投影が、900 ピクセルのオフセットを使用した半取得法によって測定されました。垂直方向の 1.5 mm のステップサイズを使用して、VOI の高さをカバーしました。

肺全体の全視野断層撮影に加えて、代表的な特徴を備えた後続のより小さい VOI が選択され、レベル 1 の 6.5 μm (5 箇所) と 6.05 μm (3 箇所) およびレベル 1 の 2.5 μm (5 箇所) を含む、より高解像度の局所断層撮影で画像化されました。レベル 2 VOI の場合はそれぞれ 2.45 μm (3 箇所)。すべての VOI は、局所断層撮影再構成から境界アーティファクトを除去した後、回転軸の周りに円筒形の視野を持ちます。変位と回転を取得するには、VGStudio Max (バージョン 3.4) で VOI を肺全体のデータに手動で空間的に登録します。それらを適用する手順は使用上の注意で説明されています。 VOI のサイズ、それらの変位、肺全体のデータの中心に対する回転を表 2 に示し、図 3a ～ d に示します。さらに、25.08 μm での肺全体のデータに関する VOI の空間位置についての簡単な解剖学的参照を表 2 に示します。追跡可能なデータの出自を保持するために、元の実験で使用されたものと同じ VOI の英数字ラベルを保持します。図 3e は、肺の下葉にある 2 つの選択された VOI を視覚化しています。

人間の左肺の HiP-CT データセットの調査。（a〜d）左肺全体内のさまざまな解像度で測定された円筒形VOIの空間的対応。 VOI の各セットについて、内側 (左) と矢状 (右) の両方のビューが表示されます。 VOI ラベルは、表 2 の割り当てに対応します。(e) それぞれ 6.5 μm および 2.5 μm のボクセルサイズを持つ 2 つの画像化された VOI のレンダリング。 (f) 肺全体と局所断層撮影データから、肺の頂端領域にある部分的に石灰化した棘状の肺結節の解剖学的詳細を複数の長さスケールで視覚化します。二次肺小葉 (SPL) の小葉間中隔と小葉周囲の血管構造が示されています。

再構成および後処理後の体積データは、ZIP フォルダーに保存された JPEG2000 形式のグレースケール (16 ビット) 2D 画像スライスとして提供されます。 JPEG2000 の圧縮レベルは、特徴の定量化や画像のセグメンテーションに使用される場合に、元の TIFF 形式のデータとの差が最小限になるように慎重に選択されています。寄託されたデータの詳細を表 3 に示します。すべてのデータは ESRF データリポジトリ (https://human-organ-atlas.esrf.eu/explore/LADAF-2020-27/left%20lung) に寄託されています。表 4 にリストされているように、スキャンされた各ボリュームに割り当てられたデジタルオブジェクト識別子 (DOI) です。各 DOI は、フル解像度のボリュームとそのビン化されたバージョンを指します。ボクセルサイズが 6.5 μm44、45、46、47、–48、6.05 μm49、50、–51、2.5 μm52、53、54、55、–56、および 2.45 μm57 のボクセルサイズを含む、局所断層撮影によって測定されたすべての VOI について、図 58、–59 では、フル解像度データ (ビニング = 1) と 2 × ビニングバージョン (ビニング = 2) の両方が提供されていますが、肺全体のデータ 60 については、4 × ビニングバージョン (ビニング = 4) も提供されています。表 2 のメタデータ情報は、各データデポジットに含まれる対応するテキストファイルにも提供されます。各 DOI に関連付けられたランディングページには、位相コントラスト断層撮影用の X 線ビームラインのパラメーター、実験スキャンプロトコル、およびデータ処理手順に関する拡張情報が含まれています。

HiP-CT スキャンの放射線量は組織損傷閾値 26 を大幅に下回っていますが、複数回の高解像度の局所断層撮影スキャン後にのみ発生する放射線誘発性の気泡形成のため、サンプルは残りの測定が行われる前に再脱気を受けました。作った。気泡は主に溶媒の蒸発によって生じますが 61、組織学が示すように可視放射線による損傷は引き起こしません 26。ただし、再脱気の結果、同じビーム時間内にすべての VOI が連続して画像化されるわけではありません。再脱気中、サンプルは元の位置を維持するために容器内に保持されました。サンプルジャーはその後、さらに画像化するためにシンクロトロン X 線ビームラインに設置されました。このプロセスでは、再脱気の前後にスキャンされた VOI が大きな変形を生じることなくボリューム全体に登録できるように注意が払われました。

画像化されたボリュームでは、肺組織の構成要素と、エタノール溶液で満たされた気道、肺胞、血管の空隙との間の局所的な密度の違いによってコントラストが生成されます（図3e、fを参照）。ボクセルサイズ25.08μmの肺全体のデータ内では、小葉間中隔、二次肺小葉62、63の境界、および小葉周囲の血管構造がはっきりと見えます（図3fを参照）。高い空間解像度では、局所的な濃度差が VOI の画像コントラストに大きく寄与するようになります 26。長さスケール全体にわたる一貫したコントラストにより、健康な個人または対照としての肺の形態を研究するための詳細な情報が得られます。

個人の総肺活量に関しては、死後の推定は、(1) 解剖学的死腔を直接測定できないこと、および (2) 死後に再現できない骨格胸部、横隔膜の構成または緊張と胸腔の間の複雑な機能的相互作用によって大幅に妨げられます。。それにもかかわらず、肺は固定時にほぼ正常な圧力で膨張しているため、ほぼ正常な吸気膨張に対する最良の仮定は、圧力制御された膨張である。さらに、準備とスキャン中に臓器の完全性を維持するために多大な努力が払われたにもかかわらず、肺の一部の胸膜下領域でわずかな圧迫が認められました。これらの特徴の潜在的な原因は次のとおりであると考えられます。 (1) 固定に使用されるホルマリンは、より末梢の肺領域に到達するのが難しい可能性があります。 (2) 寒天が肺の周囲にしっかりとフィットすることでブロックされます。 (3) 加齢による軽度の気管支傍気腫および/または胸膜下気腫の兆候5。

ここで紹介されているマルチスケールの健康なヒトの肺のデータは、Covid-19 感染による肺の微細構造内の損傷を比較する研究における臨床対照データとして使用されています26。個々の VOI は、断層撮影ジオメトリの回転軸 (図 1 の z) に垂直な 2D 画像スライスとして配置されます。これらの画像は、表示またはさらなる定量化のために、任意の一般的な画像処理ソフトウェアに直接ロードできます。 VOI を肺全体のデータに合わせるには、次の変換を VOI に適用する必要があります。

ここで、I' と I は強度値の体積データ、T は 3D 移動演算子、Rz は z 軸を中心とした 3D 回転演算子です (図 1b、c を参照)。各 VOI の変位ベクトル (dx、dy、dz) と z 回転角 θz を表 2 に示します。画像のデフォルトのグレースケール範囲は、飽和を避けるために強度マージンを持って設定されています。目で直接見るには、しきい値の調整が必要な場合があります。

前処理、断層撮影再構成、後処理に使用されるコードは、GitHub (https://github.com/HiPCTProject/Tomo_Recon) で入手できます。

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身体提供者から肺を摘出していただいた S. Bayat (INSERM)、P. Masson (LADAF)、プロジェクトの全般的な支援について H. Reichert (ESRF) と R. Torii (UCL)、そして C. Muzelle, R に感謝します。 X 線画像処理装置の開発と改善については、Homs、C. Jarnias、F. Cianciosi、P. Vieux、P. Cook、L. Capasso、A. Mirone にご協力いただきました。 A. de Maria、A. Bocciarelli、M. Bodin、J.-F. に感謝します。 ESRF の Perrin と A. Goetz に Human Organ Atlas データベースのサポートを依頼しました。著者らはまた、C. Werlein、R. Engelhardt、AM Brechlin、C. Petzold、N. Kroenke に感謝します。このプロジェクトは、シリコンバレーコミュニティ財団の助言基金であるチャンザッカーバーグイニシアチブ DAF、ESRF - 資金提案 md1252、王立工学アカデミー (PDL - CiET1819/10)、およびMRC (MR/R025673/1)。 MA は、国立衛生研究所 (HL94567 および HL134229) からの助成金を認めています。 DDJ は、ヨーロッパの Consolidator Grant、XHale (参照番号 771883) を認めています。 JJ は、ウェルカムトラスト臨床研究キャリア開発フェローシップ 209553/Z/17/Z および国立衛生研究所ユニバーシティカレッジロンドン病院生物医学研究センターに感謝します。この研究は、ウェルカムトラスト [209553/Z/17/Z] から全額または一部の資金提供を受けました。オープンアクセスを目的として、著者は、この投稿から生じた著者受理済み原稿バージョンに CC-BY の公共著作権ライセンスを適用しています。

R. Patrick Xian、Paul Tafforeau などの著者も同様に貢献しました。

ユニバーシティ・カレッジ・ロンドン機械工学科、ロンドン、英国

R・パトリック・シアン、クレア・L・ウォルシュ、セバスチャン・マルッシ、ピーター・D・リー

アントワープ外科訓練解剖学研究センター (ASTARC)、アントワープ大学、ヴィルレイク、ベルギー

スタジン E. 過去

ハイデルベルク大学病院、診断および介入放射線科、ハイデルベルク、ドイツ

ウィリー・L・ワグナー

トランスレーショナル肺研究センターハイデルベルク (TLRC)、ドイツ肺研究センター (DZL)、ハイデルベルク、ドイツ

ウィリー・L・ワグナー

フランスアルプス解剖学研究所 (LADAF)、グルノーブルアルプ大学、グルノーブル、フランス

アレクサンドル・ベリエ

病理学および分子病理学研究所、ヘリオス大学クリニックヴッパータール、ヴィッテン/ヘルデッケ大学、ヴッパータール、ドイツ

マクシミリアン・アッカーマン

機能臨床解剖学研究所、ヨハネス・グーテンベルク大学マインツ医療センター、マインツ、ドイツ

マクシミリアン・アッカーマン

ハノーバー医科大学病理学研究所、ハノーバー、ドイツ

ダニー・D・ジョニク

末期閉塞性肺疾患における生物医学研究ハノーバー (BREATH)、ドイツ肺研究センター (DZL)、ハノーバー、ドイツ

ダニー・D・ジョニク

医用画像コンピューティングセンター、ユニバーシティカレッジロンドン、ロンドン、英国

ジョセフ・ジェイコブ

英国ロンドン、ユニバーシティ・カレッジ・ロンドン病院NHS財団トラスト放射線科

ジョセフ・ジェイコブ

欧州放射光施設、グルノーブル、フランス

ポール・タフォロー

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PDL と PT がこの実験を考案しました。 PDL、CLW、PT が協力を調整しました。 AB は身体提供者から肺を採取し、PT とともに画像化のために肺を準備しました。 SM は臓器イメージング用のサンプルホルダーを設計しました。 PT は ESRF BM05 ビームラインでイメージング実験を実施し、体積データを再構築しました。 RPX は、PT、SV、WLW、JJ、MA、DDJ の支援と指示を受けてデータを分析しました。 RPX が原稿の最初のバージョンを書きました。著者全員が原稿をレビューし、議論して最終的な形に仕上げました。

R. パトリックシアン、ピーター D. リー、またはポールタフォローへの通信。

著者らは競合する利害関係を宣言していません。

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転載と許可

Xian、RP、Walsh、CL、Verleden、SE 他。人間の左肺全体のマルチスケール X 線位相コントラスト断層撮影データセット。 Sci Data 9、264 (2022)。 https://doi.org/10.1038/s41597-022-01353-y

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受信日: 2021 年 12 月 1 日

受理日: 2022 年 5 月 3 日

公開日: 2022 年 6 月 2 日

DOI: https://doi.org/10.1038/s41597-022-01353-y

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